上海外资公司进出口备案手续流程如下：
1、外经委备案
2、海关备案
3、电子口岸备案
4、检验检疫备案
5、出口退税备案
外资公司与内资企业一样均享受中国的出口退税政策。
三、外资公司特殊审批事项
1、涉及到超出上海市商务委员会审批权限的，需报商务部审批，如经营范围中涉及到资源类产品的等。
2、外资公司经营范围中涉及到前置审批的，需报相应的审批部门审批，如外资食品企业要办理食品卫生许可证等。
3、外资生产型企业需在公司名称核准后，办理环境评估报告。
不同类型的外资公司注册所需材料及流程等略有差异，具体请电话咨询。
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